El Vicerrectorado está a cargo de la gestión académica de la universidad. Su misión primordial es promover los más altos niveles de excelencia en la formación intelectual y profesional de los estudiantes de grado y posgrado, fortalecer la posición de UdeSA como uno de los principales centros de investigación básica y aplicada en las ciencias y las humanidades del país y contribuir al diseño de políticas institucionales que fomenten la producción académica de los profesores, su compromiso con la enseñanza y su pleno desarrollo profesional. El Vicerrectorado trabajará para consolidar día a día una institución donde la educación e investigación de alta calidad sean indisociables, que esté comprometida con el debate de los grandes problemas argentinos y con la difusión de ideas, abierta a la comunidad, fundada sobre la libre expresión y la pluralidad de opiniones.
Entre las áreas de incumbencia del Vicerrectorado se encuentran la estructura curricular, el Ciclo de Fundamentos, la coordinación entre las carreras, la articulación entre los programas de grado y posgrado, las políticas de apoyo e incentivo a la investigación y el régimen de contratación, categorización, evaluación periódica y promoción de los profesores.
El Vicerrector Académico está a cargo de la Oficina de Asuntos Académicos e Investigación y coordina el funcionamiento de Comités y Comisiones dedicados a desarrollar e implementar políticas institucionales en distintas áreas de la vida académica de la universidad.